DNase I(无 RNase) 货 号 #M0303L-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – RNA 试剂 – RNA 合成

DNase I(无 RNase)                              收藏

DNase I(无 RNase)                货   号                  #M0303L DNase I(无 RNase)                货   号                  #M0303L DNase I(无 RNase)                货   号                  #M0303L DNase I(无 RNase)                货   号                  #M0303L

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特性

·转录反应后 DNA 模板的降解
·除去 RNA 样品中的基因组 DNA 污染
·DNase I 印迹分析
·切刻平移

概述

DNase I(无 RNase)是一种非特异性核酸内切酶,切割 DNA 产生具有 3´ 羟基和 5´ 磷酸末端的二核苷酸、三核苷酸和寡核苷酸产物。DNase I 可以作用于单链 DNA、双链 DNA、染色质和 RNA:DNA 杂交链。 

来源

重组 E. coli 菌株,含有牛胰腺 DNase I 的 MBP 融合克隆。 

反应条件

1X DNase I 反应缓冲液
[10 mM Tris-HCl (pH 7.6 @ 25℃) ,2.5 mM MgCl2,0.5 mM CaCl2],37℃ 温育。
热失活:75℃ 10 分钟。 

质保声明

无 RNase 污染。 

单位定义

1 单位指 50 μl 反应体系中,37℃ 条件下,10 分钟完全分解 1 μg pBR322 DNA 所需要的酶量。
完全降解是指绝大多数的 DNA 片段降解成为四核苷酸或更短的核苷酸。 

浓度

2,000 units/ml。 

注意事项

为避免酶失活过程中 RNA 被降解,应添加终浓度为 5 mM 的 EDTA。 

参考文献

有关该产品特性和应用的参考文献请登陆 www.neb-china.com 或 www.neb.com。 

DNase I-XT(耐盐) 货 号 #M0570L-NEB酶试剂 New England Biolabs

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DNase I-XT(耐盐)                              收藏

DNase I-XT(耐盐)               货   号                  #M0570L DNase I-XT(耐盐)               货   号                  #M0570L DNase I-XT(耐盐)               货   号                  #M0570L

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#M0570L
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产品特性

 DNase I-XT(耐盐)               货   号                  #M0570L

·耐盐型 DNA 特异性核酸内切酶

·用于降解双链和单链 DNA

·产生具有 5′-磷酸和 3′-羟基末端的短链寡核苷酸

·不含 RNase 

    DNase I-XT(耐盐)特别适用于:

·降解体外转录反应中的 DNA 模板

·去除 RNA 样品中残留的基因组 DNA

 

产品描述

 DNase I-XT(耐盐)是基于 DNase I 改造的耐盐型 DNA 核酸内切酶,可非特异切割 DNA,产生具有 5′-磷酸和 3′-羟基末端的二核苷酸、三核苷酸和寡核苷酸产物 (1,2)DNase I-XT(耐盐)作用于单/双链 DNA、染色体,以及 RNA:DNA 杂交链上的 DNA。当盐浓度>50 mM 时,不耐盐型 DNase I(无 RNase)(NEB #M0303)的活性会受到抑制,但 DNase I-XT(耐盐)(NEB #M0570)在 50-100 mM 盐浓度范围活性最佳,盐浓度达到 200 mM 时,可维持 65% 活性,300 mM 时,仍有~40% 活性。

 

1DNase I-XT(耐盐)在盐浓度> 100 mM,能高效降解 DNA

 

DNase I-XT(耐盐)               货   号                  #M0570L

在等摩尔的 DNase I (NEB #M0303) DNase I-XT(耐盐)(NEB #M0570) DNase 活性比较中,DNase I-XT(耐盐)展示出更高的耐盐特性。检测方法为:在 1X DNase I 反应缓冲液中,消化标记有荧光和淬灭基团的发夹 dsDNA 底物(35 nt),荧光强度反映出不同盐浓度条件下的酶活(如图所示)。结果显示:DNase I 活性随着盐浓度的增加而下降,而耐盐的 DNase I-XT 在高达 300 mM 盐浓度中仍保持活性。

 

2DNase I-XT(耐盐)能够更完全的去除 IVT 反应和 RNA 中的 DNA 

 

DNase I-XT(耐盐)               货   号                  #M0570L

20 μl 体外转录产物用以下三种方法检测去除残留 DNA 的效果:1) DNase I2) 2 U TURBO® DNase 3) 2 U DNase I-XT(耐盐),37°C 条件下孵育 15 分钟。分别使用 Monarch RNA 纯化试剂盒(500 µg)(NEB #T2050)纯化,以无核酸酶水(50 µl)洗脱。使用 Luna 通用探针法 qPCR 预混液(NEB #M3004)通过 qPCR 检测 DNA 残留水平。将每个样品的平均 Cq 值与标准曲线(灰色)进行比较,以评估可 PCR-扩增 DNA 的百分比。TURBO DNase DNase I-XT(耐盐)的使用都不需要对 IVT 反应产物进行稀释,但是,DNase I-XT(耐盐)对 IVT 反应中的 DNA 模板去除更彻底,难以通过 qPCR 检测到。

 

3DNase I-XT(耐盐)有效去除 RNA 粗提产物中的残留 DNA

 DNase I-XT(耐盐)               货   号                  #M0570L

RNA 粗提样本用以下四种方法检测去除残留 DNA 的效果1) DNase I2) DNase I-XT 反应缓冲液中加入 DNase I-XT(耐盐)(2 U, NEB #M0570)3) DNase I 反应缓冲液中加入 DNase I (2 U, NEB #M0303)4) TURBO DNase 反应缓冲液中加入 TURBO DNase (2 U, ThermoFisher) 37°C 条件下孵育 15 分钟。使用 Luna 通用一步法 RT-qPCR 试剂盒 (NEB #E3005) 和人类或小鼠 Actin 外显子引物,通过+/- RTqPCR 检测对残留的基因组 DNA (gDNA) 进行定量。以 qPCR(无反转录,仅扩增DNA)与 RT-qPCR(有反转录,同时扩增 DNA RNA)平均 Cq 值的差值评估 DNase 去除 DNA 的效果。结果显示:对于 RNA 粗提产物中的残留 gDNADNase I-XT(耐盐)比 TURBO DNase 去除效果更彻底。

Recombinant DNase I (RNase-free)酶试剂盒Takara Clontech

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Recombinant DNase I (RNase-free)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Takara 2270A Recombinant DNase I (RNase-free) 1,000 U ¥501 Recombinant DNase I (RNase-free) Recombinant DNase I (RNase-free) Recombinant DNase I (RNase-free)
Takara 2270B (A × 5) Recombinant DNase I (RNase-free) 1,000 U × 5 ¥2,253 Recombinant DNase I (RNase-free) Recombinant DNase I (RNase-free) Recombinant DNase I (RNase-free)
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■ 制品内容 (Code No.: 2270A)
Recombinant DNase I (RNase-free;5 U/μl) 1,000 U
10X DNase I Buffer 1 ml
 
■ 制品说明
本酶是将单链或双链DNA同等程度的随机分解,生成具有5’-P末端寡核苷酸的脱氧核糖核酸内切酶。
由于本酶已除去了蛋白酶和核酸酶,从而提高了在pH中性区域的稳定性,适用于RNA的制备。
 
保存
-20℃。
 
起源
Recombinant enzyme derived from non-animal host.
 
活性定义
以小牛胸腺DNA为底物,在25℃、pH5.0的条件下,1分钟内使反应液的260 nm吸光度增加0.001所需要的酶量定义为1个活性单位 (Kunitz Unit)。
 
用途
1. 用T7或SP6 RNA Polymerase进行体外转录 (In vitro transcription) 时,合成RNA后,不必更换Buffer,使用Recombinant DNase I (RNase-free) 即可将模板DNA降解。
2. 与DNA Polymerase I (Code No. : 2130) 一起用于切口平移。
3. 在Mn2+存在的条件下,为鸟枪法测序 (Shotgun sequencing) 制作DNA文库。
4. 用于足迹法 (Foot-printing) 分析DNA-蛋白质相互作用。
5. 在进行RT-PCR反应前,对基因组DNA进行降解。
 
使用注意
本酶已除去蛋白酶,在最适中性pH范围内稳定。反应时需要二价金属离子参与,Mg2+存在时,能随机使双链DNA产生切口;Mn2+存在时,双链DNA的两条链被分解为片段。加入EDTA可使酶可逆性失活,75℃加热10分钟则不可逆性失活。
 
 

DNase I Reaction Buffer 货 号 #B0303S-NEB酶试剂 New England Biolabs

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DNase I Reaction Buffer                              收藏

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#B0303S
6 ml
339.00

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