适用仪器

样品实验方案

简要概述

1. 准备Helixyte Green BR工作溶液
2. 在每个0.2 mL PCR管中加入190 uL 1X Helixyte Green BR工作溶液
3. 在每个试管中添加10 uL DNA标准溶液或测试样品
4. 在室温下孵育2分钟
5. 使用CytoCite 荧光仪或Qubit 检测荧光

注意：打开之前，请将所有成分置于室温下。

溶液配制

工作溶液配制

Helixyte Green-BR工作溶液：在DNA分析缓冲液（组分B）中稀释200倍Portelite dsDNA试剂（组分A）。 例如，要为8个样品准备足够的工作溶液，请将5uL Helixyte Green BR（组分A）添加到1mL DNA分析缓冲液（组分B）中。注意：通过用箔纸覆盖或将其置于黑暗中来保护工作液免受光照。 我们建议在塑料容器中操作而不是玻璃中制备该溶液，因为染料可能会吸附到玻璃表面。 为了获得最佳结果，应在准备后的几个小时内使用此溶液。

实验步骤

根据DNA样品的估计浓度，样品量可以在1〜20 uL的范围内。推荐的样品量为10 uL，DNA浓度在0.2〜100 ng / uL范围内。如果使用其他样品体积，请在浓度计算中调整稀释倍数。

10 uL样品体积（DNA浓度在0.2〜100 ng / uL范围内）实验方案。

1. 在每个Cytocite 样品管（＃CCT100）或等效的0.2 mL PCR管中添加190 uL 1X Helixyte Green BR工作溶液。注意：请使用薄壁聚丙烯透明0.2 mL PCR管，例如＃CCT100。
2. 向每个试管中加入10 µL DNA标准品或测试样品，然后离心2〜3秒进行混合。
3. 将所有试管在室温下孵育2分钟。
4. 将样品插入CytoCite 或Quibit 中，并通过绿色荧光通道检测荧光。若使用CytoCite，请遵循适用于CytoCite 荧光仪的程序。

标准校准曲线的准备

对于Portelite 分析，您可以选择使用DNA标准液绘制校正曲线。

1. 在DNA分析缓冲液（成分B）中，用100 ng/uL的DNA标准BR#2（成分D）进行1/3系列稀释，得到30、10、3、1、0.3、0.1和0 ng/uL的DNA标准稀释液。
2. 在每个试管中加入190 uL Helixyte Green BR工作溶液。
3. 将10 uL标准液或10 uL样品添加到0.2 mL PCR管中。
4. 将反应在室温下孵育2分钟。
5. 将样品插入CytoCite ，并通过绿色荧光通道检测荧光。

图示

图1.使用具有宽动态范围的Portelite 荧光DNA定量试剂盒生成的DNA标准曲线。 使用绿色荧光通道定量荧光强度，使用线性拟合计算回归模型。

参考文献

A new reporter design based on DNA origami nanostructures for quantification of short oligonucleotides using microbeads
Authors: Choi, Y., Schmidt, C., Tinnefeld, P., Bald, I., Rodiger, S.
Journal: Sci Rep (2019): 4769

A universal fluorescence-based toolkit for real-time quantification of DNA and RNA nuclease activity
Authors: Sheppard, E. C., Rogers, S., Harmer, N. J., Chahwan, R.
Journal: Sci Rep (2019): 8853

Effects of Quantification Methods, Isolation Kits, Plasma Biobanking, and Hemolysis on Cell-Free DNA Analysis in Plasma
Authors: Streleckiene, G., Forster, M., Inciuraite, R., Lukosevicius, R., Skieceviciene, J.
Journal: Biopreserv Biobank (2019): ersion=”1.0″ encoding=”UTF-8″ ?>17645.enlEndNote1117Streleckiene, G.Forster, M.Inciuraite, R.Lukosevicius, R.Skieceviciene, J.1Institute for Digestive Research, Lithuanian University of Health Sciences, Kaunas, Lithuania. 2Institute of Clinical Molecu

Flat-top TIRF illumination boosts DNA-PAINT imaging and quantification
Authors: Stehr, F., Stein, J., Schueder, F., Schwille, P., Jungmann, R.
Journal: Nat Commun (2019): 1268

Molecular-Recognition-Based DNA Nanodevices for Enhancing the Direct Visualization and Quantification of Single Vesicles of Tumor Exosomes in Plasma Microsamples
Authors: He, D., Ho, S. L., Chan, H. N., Wang, H., Hai, L., He, X., Wang, K., Li, H. W.
Journal: Anal Chem (2019): 2768-2775

Quantification of fixed adherent cells using a strong enhancer of the fluorescence of DNA dyes
Authors: Ligasova, A., Koberna, K.
Journal: Sci Rep (2019): 8701

A fluorescent reporter for quantification and enrichment of DNA editing by APOBEC-Cas9 or cleavage by Cas9 in living cells
Authors: St Martin, A., Salamango, D., Serebrenik, A., Shaban, N., Brown, W. L., Donati, F., Munagala, U., Conticello, S. G., Harris, R. S.
Journal: Nucleic Acids Res (2018): e84

Accuracy of human sperm DNA oxidation quantification and threshold determination using an 8-OHdG immuno-detection assay
Authors: Vorilhon, S., Brugnon, F., Kocer, A., Dollet, S., Bourgne, C., Berger, M., Janny, L., Pereira, B., Aitken, R. J., Moazamian, A., Gharagozloo, P., Drevet, J., Pons-Rejraji, H.
Journal: Hum Reprod (2018): 553-562

Cell Type-Specific Quantification of Telomere Length and DNA Double-strand Breaks in Individual Lung Cells by Fluorescence In Situ Hybridization and Fluorescent Immunohistochemistry
Authors: van Batenburg, A. A., Kazemier, K. M., Peeters, T., van Oosterhout, M. F. M., van der Vis, J. J., Grutters, J. C., Goldschmeding, R., van Moorsel, C. H. M.
Journal: J Histochem Cytochem (2018): 485-495

Identification and Quantification of Heterogeneously-methylated DNA Fragments Using Epiallele-sensitive Droplet Digital Polymerase Chain Reaction (EAST-ddPCR)
Authors: Menschikowski, M., J and eck, C., Friedemann, M., Richter, S., Thiem, D., Lange, B. S., Suttorp, M.
Journal: Cancer Genomics Proteomics (2018): 299-312

染色样本分析

操作步骤

1.准备蛋白质储备溶液（溶液A）：

将100μL反应缓冲液（如1 M碳酸钠溶液或1 M磷酸盐缓冲液，pH~9.0）与900μL目标蛋白溶液（如抗体，蛋白质浓度> 2 mg / ml，如果可能）混合至100μL给予1 mL蛋白质标记原液。

注1：蛋白质溶液（溶液A）的pH值应为8.5±0.5。如果蛋白质溶液的pH低于8.0，则使用1M碳酸氢钠溶液或1M pH 9.0磷酸盐缓冲液将pH调节至8.0-9.0的范围。

注2：蛋白质应溶解于pH7.2-7.4的1X磷酸盐缓冲盐水（PBS）中。如果蛋白质溶解在Tris或甘氨酸缓冲液中，则必须用pH7.2-7.4的1X PBS透析，以除去广泛用于蛋白质沉淀的游离胺或铵盐（例如硫酸铵和乙酸铵）。

注3：不纯抗体、牛血清白蛋白（BSA）或明胶稳定的抗体不会被很好地标记。叠氮化钠或硫柳汞的存在也可能干扰缀合反应。可以通过透析或旋转柱除去叠氮化钠或硫柳汞，以获得极佳标记结果。

注4：如果蛋白质浓度低于2 mg / mL，则结合效率会显着降低。为获得极佳标记效率，建议极终蛋白质浓度范围为2-10 mg / mL。

2.准备染料储备溶液（溶液B）：

将无水DMSO加入到iFluor 染料SE小瓶中以制备10-20mM储备溶液。 通过移液或涡旋混合均匀。

注意：在开始缀合前准备染料储备溶液（溶液B）。 及时使用。 染料储备溶液的长期储存可降低染料活性。 溶液B可在冰箱中保存两周，避光保存。 避免冻融循环。

3.确定极佳染料/蛋白质比例（可选）：

注意：每种蛋白质都需要不同的染料/蛋白质比例，这也取决于染料的性质。蛋白质的过度标记可能不利地影响其结合亲和力，而低染料/蛋白质比率的蛋白质缀合物会降低灵敏度。我们建议您通过使用连续不同量的标记染料溶液重复步骤4和5来实验确定极佳染料/蛋白质比率。通常，对于大多数染料 – 蛋白质缀合物，推荐使用4-6种染料/蛋白质。

3.1使用10：1摩尔比的溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）作为起始点：将5μl染料储备溶液（溶液B，假设染料储备溶液为10 mM）加入到样品瓶中。蛋白质溶液（95μl溶液A）有效摇动。假设蛋白质浓度为10mg / mL并且蛋白质的分子量为~200KD，蛋白质的浓度为~0.05mM。

注意：蛋白质溶液中DMSO的浓度应<10％。

3.2运行缀合反应（参见下面的步骤4）。

3.3重复＃3.2，溶液B /溶液A的摩尔比为5：1;分别为15：1和20：1。

3.4使用预制的旋转柱纯化所需的缀合物。

3.5计算上述4种结合物的染料/蛋白质比（DOS）（见说明书）。

3.6运行上述4种结合物的功能测试，确定极佳的染料/蛋白质比例，以扩大标记反应。

4.运行结合反应：

4.1有效加入适量的染料储备溶液（溶液B）到蛋白质溶液（溶液A）的小瓶中晃动。

注意：溶液B /溶液的极佳摩尔比由步骤3.6确定。如果跳过步骤3，我们建议使用10：1溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）的摩尔比。

4.2继续在室温下旋转或摇动反应混合物30-60分钟。

5.纯化缀合物

以下方案是使用Sephadex G-25柱纯化染料 – 蛋白质缀合物的实例。

5.1按照制造说明准备Sephadex G-25色谱柱。

5.2将反应混合物（直接从步骤4）加载到Sephadex G-25柱的顶部。

5.3样品在顶部树脂表面下方运行时立即加入PBS（pH 7.2-7.4）。

5.4向所需样品中加入更多PBS（pH 7.2-7.4）以完成色谱柱纯化。 合并含有所需染料 – 蛋白质缀合物的级分。

注1：立即使用时，染料 – 蛋白质偶联物需要用染色缓冲液稀释，并等分多次使用。

注2：对于长期储存，染料 – 蛋白质缀合物溶液需要浓缩或冷冻干燥

参考文献

Deep Sequencing Analysis of the Eha-Regulated Transcriptome of Edwardsiella tarda Following Acidification
Authors: D Gao, N Liu, Y Li, Y Zhang, G Liu
Journal: Metabolomics (Los Angel) (2017): 2153–0769

Suramin inhibits cullin-RING E3 ubiquitin ligases
Authors: Kenneth Wu, Robert A Chong, Qing Yu, Jin Bai, Donald E Spratt, Kevin Ching, Chan Lee, Haibin Miao, Inger Tappin, Jerard Hurwitz
Journal: Proceedings of the National Academy of Sciences (2016): E2011–E2018

Glycosaminoglycan mimicry by COAM reduces melanoma growth through chemokine induction and function
Authors: Helene Piccard, Nele Berghmans, Eva Korpos, Chris Dillen, Ilse Van Aelst, Sandra Li, Erik Martens, Sandra Liekens, Sam Noppen, Jo Van Damme
Journal: International Journal of Cancer (2012): E425–E436

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染色样本分析

操作步骤

1.准备蛋白质储备溶液（溶液A）：

将100μL反应缓冲液（如1 M碳酸钠溶液或1 M磷酸盐缓冲液，pH~9.0）与900μL目标蛋白溶液（如抗体，蛋白质浓度> 2 mg / ml，如果可能）混合至100μL给予1 mL蛋白质标记原液。

注1：蛋白质溶液（溶液A）的pH值应为8.5±0.5。如果蛋白质溶液的pH低于8.0，则使用1M碳酸氢钠溶液或1M pH 9.0磷酸盐缓冲液将pH调节至8.0-9.0的范围。

注2：蛋白质应溶解于pH7.2-7.4的1X磷酸盐缓冲盐水（PBS）中。如果蛋白质溶解在Tris或甘氨酸缓冲液中，则必须用pH7.2-7.4的1X PBS透析，以除去广泛用于蛋白质沉淀的游离胺或铵盐（例如硫酸铵和乙酸铵）。

注3：不纯抗体、牛血清白蛋白（BSA）或明胶稳定的抗体不会被很好地标记。叠氮化钠或硫柳汞的存在也可能干扰缀合反应。可以通过透析或旋转柱除去叠氮化钠或硫柳汞，以获得极佳标记结果。

注4：如果蛋白质浓度低于2 mg / mL，则结合效率会显着降低。为获得极佳标记效率，建议极终蛋白质浓度范围为2-10 mg / mL。

2.准备染料储备溶液（溶液B）：

将无水DMSO加入到iFluor 染料SE小瓶中以制备10-20mM储备溶液。 通过移液或涡旋混合均匀。

注意：在开始缀合前准备染料储备溶液（溶液B）。 及时使用。 染料储备溶液的长期储存可降低染料活性。 溶液B可在冰箱中保存两周，避光保存。 避免冻融循环。

3.确定极佳染料/蛋白质比例（可选）：

注意：每种蛋白质都需要不同的染料/蛋白质比例，这也取决于染料的性质。蛋白质的过度标记可能不利地影响其结合亲和力，而低染料/蛋白质比率的蛋白质缀合物会降低灵敏度。我们建议您通过使用连续不同量的标记染料溶液重复步骤4和5来实验确定极佳染料/蛋白质比率。通常，对于大多数染料 – 蛋白质缀合物，推荐使用4-6种染料/蛋白质。

3.1使用10：1摩尔比的溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）作为起始点：将5μl染料储备溶液（溶液B，假设染料储备溶液为10 mM）加入到样品瓶中。蛋白质溶液（95μl溶液A）有效摇动。假设蛋白质浓度为10mg / mL并且蛋白质的分子量为~200KD，蛋白质的浓度为~0.05mM。

注意：蛋白质溶液中DMSO的浓度应<10％。

3.2运行缀合反应（参见下面的步骤4）。

3.3重复＃3.2，溶液B /溶液A的摩尔比为5：1;分别为15：1和20：1。

3.4使用预制的旋转柱纯化所需的缀合物。

3.5计算上述4种结合物的染料/蛋白质比（DOS）（见说明书）。

3.6运行上述4种结合物的功能测试，确定极佳的染料/蛋白质比例，以扩大标记反应。

4.运行结合反应：

4.1有效加入适量的染料储备溶液（溶液B）到蛋白质溶液（溶液A）的小瓶中晃动。

注意：溶液B /溶液的极佳摩尔比由步骤3.6确定。如果跳过步骤3，我们建议使用10：1溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）的摩尔比。

4.2继续在室温下旋转或摇动反应混合物30-60分钟。

5.纯化缀合物

以下方案是使用Sephadex G-25柱纯化染料 – 蛋白质缀合物的实例。

5.1按照制造说明准备Sephadex G-25色谱柱。

5.2将反应混合物（直接从步骤4）加载到Sephadex G-25柱的顶部。

5.3样品在顶部树脂表面下方运行时立即加入PBS（pH 7.2-7.4）。

5.4向所需样品中加入更多PBS（pH 7.2-7.4）以完成色谱柱纯化。 合并含有所需染料 – 蛋白质缀合物的级分。

注1：立即使用时，染料 – 蛋白质偶联物需要用染色缓冲液稀释，并等分多次使用。

注2：对于长期储存，染料 – 蛋白质缀合物溶液需要浓缩或冷冻干燥

参考文献

Deep Sequencing Analysis of the Eha-Regulated Transcriptome of Edwardsiella tarda Following Acidification
Authors: D Gao, N Liu, Y Li, Y Zhang, G Liu
Journal: Metabolomics (Los Angel) (2017): 2153–0769

Suramin inhibits cullin-RING E3 ubiquitin ligases
Authors: Kenneth Wu, Robert A Chong, Qing Yu, Jin Bai, Donald E Spratt, Kevin Ching, Chan Lee, Haibin Miao, Inger Tappin, Jerard Hurwitz
Journal: Proceedings of the National Academy of Sciences (2016): E2011–E2018

Glycosaminoglycan mimicry by COAM reduces melanoma growth through chemokine induction and function
Authors: Helene Piccard, Nele Berghmans, Eva Korpos, Chris Dillen, Ilse Van Aelst, Sandra Li, Erik Martens, Sandra Liekens, Sam Noppen, Jo Van Damme
Journal: International Journal of Cancer (2012): E425–E436

相关产品

产品基本信息

货号：11078

产品名称：AF568 酪胺

规格：200 Slides

储存条件：-15℃避光防潮

保质期：24个月

产品物理化学光谱特性

分子量：813.89

溶剂：DMSO

激发波长(nm)：579

发射波长(nm)：603

产品介绍

AF568 酪胺是美国AAT Bioquest生产的用于荧光标记的试剂，对于许多免疫组织化学（IHC）应用，传统的酶促扩增程序足以实现足够的抗原检测。但是，有几个因素限制了这些程序的敏感性和实用性。 Tyramide信号放大（TSA）已被证明是一种特别通用且强大的酶扩增技术，提高了检测灵敏度。TSA依靠HRP在低浓度过氧化氢的存在下将含有标记酪胺的底物转化为氧化的高反应性自由基的能力，该自由基可与HRP处或附近的酪氨酸残基共价结合。为了实现最大IHC检测，酪胺用荧光团预标记，每个过氧化物酶标记物的多个酪胺底物转换所赋予的信号放大转化了对低丰度靶标的超灵敏检测以及使用较少量的抗体和杂交探针。在免疫组织化学应用中，源自TSA方法的灵敏度增强允许增加一级抗体稀释以减少非特异性背景信号，并且可以克服由次优固定程序或低水平靶表达引起的弱免疫标记。 AF568 酪胺含有极其明亮且可光稳定的AF568 酪胺，可通过标准FITC滤波器组轻松检测到。金畔生物是AAT Bioquest的中国代理商，为您提供最优质的AF568 酪胺。 

点击查看光谱

• AAT Bioquest iFluor 染料干货锦集 你想了解的都在这里
• 锦囊：iFluor 系列染料大集合

参考文献

High Resolution Fluorescent In Situ Hybridization in Drosophila Embryos and Tissues Using Tyramide Signal Amplification
Authors: J and ura, A., Hu, J., Wilk, R., Krause, H. M.
Journal: J Vis Exp (2017): se name=”11070.enl” path=”C:WebsiteReferencesEN Files11070.enl”>11070.enlEndNote3317Jandura, A.Hu, J.Wilk, R.Krause, H. M.The Terrence Donnelly Centre for Cellular and Biomolecular Research, University of Toronto; Department of Molecular Genetics, Uni

Signal amplification in the detection of single-copy DNA and RNA by enzyme-catalyzed deposition (CARD) of the novel fluorescent reporter substrate Cy3.29-tyramide
Authors: Schmidt, B. F., Chao, J., Zhu, Z., DeBiasio, R. L., Fisher, G.
Journal: J Histochem Cytochem (1997): 365-73

iFluor 800 琥珀酰亚胺酯是美国AAT Bioquest生产的荧光染料，iFluor 染料是一系列优秀的荧光标记染料，可以覆盖整个可见光谱。所有iFluor 染料都具有优异的水溶性。它们的亲水性使有机溶剂的使用极小化。iFluor 染料也具有比经典荧光标记染料更好的标记性能，如FITC，TRITC，Texas Red ，Cy3 ，Cy5和Cy7。一些iFluor 染料在某些抗体上明显优于Alexa Fluor 标记染料。它们是用于标记蛋白质和核酸而不包含性能的极便宜的荧光染料（替代Alexa Fluor 染料）。每种iFluor染料的开发都与特定的Alexa Fluor 或其他标记染料（如DyLight 染料）的光谱特性相匹配。

琥珀酰亚胺基（NHS）酯被证明是用于胺修饰的极佳试剂，因为形成的酰胺键基本上与天然肽键相同并且稳定。这些试剂通常是稳定的并且与脂族胺显示出良好的反应性和选择性。当琥珀酰亚胺酯化合物用于缀合反应时，需要考虑的因素很少：1）溶剂：在大多数情况下，活性染料应溶于无水二甲基甲酰胺（DMF）或二甲基亚砜（DMSO）中。 2）反应pH：胺与琥珀酰亚胺酯的标记反应强烈依赖于pH。胺反应性试剂与非质子化脂族胺基团反应，包括蛋白质的末端胺和赖氨酸的β-氨基。因此，胺酰化反应通常在pH 7.5以上进行。通过琥珀酰亚胺酯进行的蛋白质修饰通常可以在pH 8.5-9.5下进行。 3）反应缓冲液：使用胺反应试剂时，必须避免使用含有游离胺（如Tris和甘氨酸）和硫醇化合物的缓冲液。广泛用于蛋白质沉淀的铵盐（例如硫酸铵和乙酸铵）也必须在进行染料缀合之前除去（例如通过透析）。 4）反应温度：大多数缀合在室温下进行。然而，特定标记反应可能需要升高或降低的温度。金畔生物是AAT Bioquest的中国代理商，为您提供最优质的iFluor 800 琥珀酰亚胺酯。 

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• AAT Bioquest iFluor 染料干货锦集 你想了解的都在这里
• 锦囊：iFluor 系列染料大集合

染色样本分析

操作步骤

1.准备蛋白质储备溶液（溶液A）：

将100μL反应缓冲液（如1 M碳酸钠溶液或1 M磷酸盐缓冲液，pH~9.0）与900μL目标蛋白溶液（如抗体，蛋白质浓度> 2 mg / ml，如果可能）混合至100μL给予1 mL蛋白质标记原液。

注1：蛋白质溶液（溶液A）的pH值应为8.5±0.5。如果蛋白质溶液的pH低于8.0，则使用1M碳酸氢钠溶液或1M pH 9.0磷酸盐缓冲液将pH调节至8.0-9.0的范围。

注2：蛋白质应溶解于pH7.2-7.4的1X磷酸盐缓冲盐水（PBS）中。如果蛋白质溶解在Tris或甘氨酸缓冲液中，则必须用pH7.2-7.4的1X PBS透析，以除去广泛用于蛋白质沉淀的游离胺或铵盐（例如硫酸铵和乙酸铵）。

注3：不纯抗体、牛血清白蛋白（BSA）或明胶稳定的抗体不会被很好地标记。叠氮化钠或硫柳汞的存在也可能干扰缀合反应。可以通过透析或旋转柱除去叠氮化钠或硫柳汞，以获得极佳标记结果。

注4：如果蛋白质浓度低于2 mg / mL，则结合效率会显着降低。为获得极佳标记效率，建议极终蛋白质浓度范围为2-10 mg / mL。

2.准备染料储备溶液（溶液B）：

将无水DMSO加入到iFluor 染料SE小瓶中以制备10-20mM储备溶液。 通过移液或涡旋混合均匀。

注意：在开始缀合前准备染料储备溶液（溶液B）。 及时使用。 染料储备溶液的长期储存可降低染料活性。 溶液B可在冰箱中保存两周，避光保存。 避免冻融循环。

3.确定极佳染料/蛋白质比例（可选）：

注意：每种蛋白质都需要不同的染料/蛋白质比例，这也取决于染料的性质。蛋白质的过度标记可能不利地影响其结合亲和力，而低染料/蛋白质比率的蛋白质缀合物会降低灵敏度。我们建议您通过使用连续不同量的标记染料溶液重复步骤4和5来实验确定极佳染料/蛋白质比率。通常，对于大多数染料 – 蛋白质缀合物，推荐使用4-6种染料/蛋白质。

3.1使用10：1摩尔比的溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）作为起始点：将5μl染料储备溶液（溶液B，假设染料储备溶液为10 mM）加入到样品瓶中。蛋白质溶液（95μl溶液A）有效摇动。假设蛋白质浓度为10mg / mL并且蛋白质的分子量为~200KD，蛋白质的浓度为~0.05mM。

注意：蛋白质溶液中DMSO的浓度应<10％。

3.2运行缀合反应（参见下面的步骤4）。

3.3重复＃3.2，溶液B /溶液A的摩尔比为5：1;分别为15：1和20：1。

3.4使用预制的旋转柱纯化所需的缀合物。

3.5计算上述4种结合物的染料/蛋白质比（DOS）（见说明书）。

3.6运行上述4种结合物的功能测试，确定极佳的染料/蛋白质比例，以扩大标记反应。

4.运行结合反应：

4.1有效加入适量的染料储备溶液（溶液B）到蛋白质溶液（溶液A）的小瓶中晃动。

注意：溶液B /溶液的极佳摩尔比由步骤3.6确定。如果跳过步骤3，我们建议使用10：1溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）的摩尔比。

4.2继续在室温下旋转或摇动反应混合物30-60分钟。

5.纯化缀合物

以下方案是使用Sephadex G-25柱纯化染料 – 蛋白质缀合物的实例。

5.1按照制造说明准备Sephadex G-25色谱柱。

5.2将反应混合物（直接从步骤4）加载到Sephadex G-25柱的顶部。

5.3样品在顶部树脂表面下方运行时立即加入PBS（pH 7.2-7.4）。

5.4向所需样品中加入更多PBS（pH 7.2-7.4）以完成色谱柱纯化。 合并含有所需染料 – 蛋白质缀合物的级分。

注1：立即使用时，染料 – 蛋白质偶联物需要用染色缓冲液稀释，并等分多次使用。

注2：对于长期储存，染料 – 蛋白质缀合物溶液需要浓缩或冷冻干燥

参考文献

Nanovesicle delivery to the liver via retinol binding protein and platelet-derived growth factor receptors: how targeting ligands affect biodistribution
Authors: Ching-Yun Hsu, Chun-Han Chen, Ibrahim A Aljuffali, You-Shan Dai, Jia-You Fang
Journal: Nanomedicine (2017)

相关产品

产品基本信息

货号：21212

产品名称：RatioWorks PH165, AM pH荧光探针

规格：10×50 ug

储存条件：-15℃避光防潮

保质期：24个月

产品物理化学光谱特性

分子量：612.56

溶剂：DMSO

激发波长(nm)：463

发射波长(nm)：641

产品介绍

RatioWorks PH165 AM是一种新型荧光探针，可用于测量活细胞中的细胞内pH。 它的双重激发和双重发射使其成为用于分析活细胞的独特比例式pH探针。 在低pH值下，RatioWorks PH165在远红光谱区域的荧光很弱，而在红光谱区域的荧光很强。 随着pH的增加，它在远红光谱中显示出较高的荧光，而在红光谱中显示出较低的荧光。该探针可分别在497/594 nm和578/654 nm双重激发/发射下定量测定4至9范围内的胞质pH。 PH165的pKa为〜7.1。 RatioWorks PH165的红色荧光光谱使其适用于绿色荧光团（例如GFP）的多重检测。 RatioWorks PH165 AM具有细胞渗透性，并与各种平台兼容，例如荧光显微镜和酶标仪。金畔生物是AAT Bioquest的中国代理商，为您提供最优质的RatioWorks PH165, AM pH荧光探针。 

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图示

图1.使用RatioWorks PH165，AM和荧光显微镜对HeLa细胞进行比例分析。 将HeLa细胞在37°C下用RatioWorks PH165，AM染色90分钟，然后转移到不同pH的溶液中。 使用Cy3 / TRITC和Cy5滤波器组（红色）获取图像。

图2.使用RatioWorks PH165，AM和酶标仪对HeLa细胞进行比例分析。 将HeLa细胞在37°C下用RatioWorks PH165，AM染色30分钟，然后转移到不同pH的溶液中。 使用Ex / Em = 497/594 nm和578/654 nm使用荧光酶标仪测量RFU，计算并绘制594/654 nm的比值。

参考文献

Intracellular pH Measurements in Glioblastoma Cells Using the pH-Sensitive Dye BCECF
Authors: Galifianakis, N. V., Placantonakis, D. G., Chesler, M.
Journal: Methods Mol Biol (2018): 103-109

Evaluation of BCECF fluorescence ratio imaging to properly measure gastric intramucosal pH variations in vivo
Authors: Rochon, P., Jourdain, M., Mangalaboyi, J., Fourrier, F., Soulie-Begu, S., Buys, B., Dehlin, G., Lesage, J. C., Chambrin, M. C., Mordon, S.
Journal: J Biomed Opt (2007): 064014

Calibration methods and avoidance of errors in measurement of intracellular pH (pHcyt) using the indicator bis(carboxyethyl)-5(6)-carboxyfluorescein (BCECF) in human platelets
Authors: Valant, P. A., Haynes, D. H.
Journal: J Fluoresc (1992): 191-206

Estimation of intramitochondrial pca and ph by fura-2 and 2,7 biscarboxyethyl-5(6)-carboxyfluorescein (bcecf) fluorescence
Authors: Davis MH, Altschuld RA, Jung DW, Brierley GP.
Journal: Biochem Biophys Res Commun (1987): 40

iFluor 800 琥珀酰亚胺酯是美国AAT Bioquest生产的荧光染料，iFluor 染料是一系列优秀的荧光标记染料，可以覆盖整个可见光谱。所有iFluor 染料都具有优异的水溶性。它们的亲水性使有机溶剂的使用极小化。iFluor 染料也具有比经典荧光标记染料更好的标记性能，如FITC，TRITC，Texas Red ，Cy3 ，Cy5和Cy7。一些iFluor 染料在某些抗体上明显优于Alexa Fluor 标记染料。它们是用于标记蛋白质和核酸而不包含性能的极便宜的荧光染料（替代Alexa Fluor 染料）。每种iFluor染料的开发都与特定的Alexa Fluor 或其他标记染料（如DyLight 染料）的光谱特性相匹配。

琥珀酰亚胺基（NHS）酯被证明是用于胺修饰的极佳试剂，因为形成的酰胺键基本上与天然肽键相同并且稳定。这些试剂通常是稳定的并且与脂族胺显示出良好的反应性和选择性。当琥珀酰亚胺酯化合物用于缀合反应时，需要考虑的因素很少：1）溶剂：在大多数情况下，活性染料应溶于无水二甲基甲酰胺（DMF）或二甲基亚砜（DMSO）中。 2）反应pH：胺与琥珀酰亚胺酯的标记反应强烈依赖于pH。胺反应性试剂与非质子化脂族胺基团反应，包括蛋白质的末端胺和赖氨酸的β-氨基。因此，胺酰化反应通常在pH 7.5以上进行。通过琥珀酰亚胺酯进行的蛋白质修饰通常可以在pH 8.5-9.5下进行。 3）反应缓冲液：使用胺反应试剂时，必须避免使用含有游离胺（如Tris和甘氨酸）和硫醇化合物的缓冲液。广泛用于蛋白质沉淀的铵盐（例如硫酸铵和乙酸铵）也必须在进行染料缀合之前除去（例如通过透析）。 4）反应温度：大多数缀合在室温下进行。然而，特定标记反应可能需要升高或降低的温度。金畔生物是AAT Bioquest的中国代理商，为您提供最优质的iFluor 800 琥珀酰亚胺酯。 

点击查看光谱

点击查看实验方案

• AAT Bioquest iFluor 染料干货锦集 你想了解的都在这里
• 锦囊：iFluor 系列染料大集合

染色样本分析

操作步骤

1.准备蛋白质储备溶液（溶液A）：

将100μL反应缓冲液（如1 M碳酸钠溶液或1 M磷酸盐缓冲液，pH~9.0）与900μL目标蛋白溶液（如抗体，蛋白质浓度> 2 mg / ml，如果可能）混合至100μL给予1 mL蛋白质标记原液。

注1：蛋白质溶液（溶液A）的pH值应为8.5±0.5。如果蛋白质溶液的pH低于8.0，则使用1M碳酸氢钠溶液或1M pH 9.0磷酸盐缓冲液将pH调节至8.0-9.0的范围。

注2：蛋白质应溶解于pH7.2-7.4的1X磷酸盐缓冲盐水（PBS）中。如果蛋白质溶解在Tris或甘氨酸缓冲液中，则必须用pH7.2-7.4的1X PBS透析，以除去广泛用于蛋白质沉淀的游离胺或铵盐（例如硫酸铵和乙酸铵）。

注3：不纯抗体、牛血清白蛋白（BSA）或明胶稳定的抗体不会被很好地标记。叠氮化钠或硫柳汞的存在也可能干扰缀合反应。可以通过透析或旋转柱除去叠氮化钠或硫柳汞，以获得极佳标记结果。

注4：如果蛋白质浓度低于2 mg / mL，则结合效率会显着降低。为获得极佳标记效率，建议极终蛋白质浓度范围为2-10 mg / mL。

2.准备染料储备溶液（溶液B）：

将无水DMSO加入到iFluor 染料SE小瓶中以制备10-20mM储备溶液。 通过移液或涡旋混合均匀。

注意：在开始缀合前准备染料储备溶液（溶液B）。 及时使用。 染料储备溶液的长期储存可降低染料活性。 溶液B可在冰箱中保存两周，避光保存。 避免冻融循环。

3.确定极佳染料/蛋白质比例（可选）：

注意：每种蛋白质都需要不同的染料/蛋白质比例，这也取决于染料的性质。蛋白质的过度标记可能不利地影响其结合亲和力，而低染料/蛋白质比率的蛋白质缀合物会降低灵敏度。我们建议您通过使用连续不同量的标记染料溶液重复步骤4和5来实验确定极佳染料/蛋白质比率。通常，对于大多数染料 – 蛋白质缀合物，推荐使用4-6种染料/蛋白质。

3.1使用10：1摩尔比的溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）作为起始点：将5μl染料储备溶液（溶液B，假设染料储备溶液为10 mM）加入到样品瓶中。蛋白质溶液（95μl溶液A）有效摇动。假设蛋白质浓度为10mg / mL并且蛋白质的分子量为~200KD，蛋白质的浓度为~0.05mM。

注意：蛋白质溶液中DMSO的浓度应<10％。

3.2运行缀合反应（参见下面的步骤4）。

3.3重复＃3.2，溶液B /溶液A的摩尔比为5：1;分别为15：1和20：1。

3.4使用预制的旋转柱纯化所需的缀合物。

3.5计算上述4种结合物的染料/蛋白质比（DOS）（见说明书）。

3.6运行上述4种结合物的功能测试，确定极佳的染料/蛋白质比例，以扩大标记反应。

4.运行结合反应：

4.1有效加入适量的染料储备溶液（溶液B）到蛋白质溶液（溶液A）的小瓶中晃动。

注意：溶液B /溶液的极佳摩尔比由步骤3.6确定。如果跳过步骤3，我们建议使用10：1溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）的摩尔比。

4.2继续在室温下旋转或摇动反应混合物30-60分钟。

5.纯化缀合物

以下方案是使用Sephadex G-25柱纯化染料 – 蛋白质缀合物的实例。

5.1按照制造说明准备Sephadex G-25色谱柱。

5.2将反应混合物（直接从步骤4）加载到Sephadex G-25柱的顶部。

5.3样品在顶部树脂表面下方运行时立即加入PBS（pH 7.2-7.4）。

5.4向所需样品中加入更多PBS（pH 7.2-7.4）以完成色谱柱纯化。 合并含有所需染料 – 蛋白质缀合物的级分。

注1：立即使用时，染料 – 蛋白质偶联物需要用染色缓冲液稀释，并等分多次使用。

注2：对于长期储存，染料 – 蛋白质缀合物溶液需要浓缩或冷冻干燥

参考文献

Nanovesicle delivery to the liver via retinol binding protein and platelet-derived growth factor receptors: how targeting ligands affect biodistribution
Authors: Ching-Yun Hsu, Chun-Han Chen, Ibrahim A Aljuffali, You-Shan Dai, Jia-You Fang
Journal: Nanomedicine (2017)

相关产品

iFluor 810 琥珀酰亚胺酯是美国AAT Bioquest生产的荧光染料，iFluor 染料是一系列优秀的荧光标记染料，可以覆盖整个可见光谱。所有iFluor 染料都具有优异的水溶性。它们的亲水性使有机溶剂的使用极小化。iFluor 染料也具有比经典荧光标记染料更好的标记性能，如FITC，TRITC，Texas Red ，Cy3 ，Cy5和Cy7。一些iFluor 染料在某些抗体上明显优于Alexa Fluor 标记染料。它们是用于标记蛋白质和核酸而不包含性能的极便宜的荧光染料（替代Alexa Fluor 染料）。每种iFluor染料的开发都与特定的Alexa Fluor 或其他标记染料（如DyLight 染料）的光谱特性相匹配。

琥珀酰亚胺基（NHS）酯被证明是用于胺修饰的极佳试剂，因为形成的酰胺键基本上与天然肽键相同并且稳定。这些试剂通常是稳定的并且与脂族胺显示出良好的反应性和选择性。当琥珀酰亚胺酯化合物用于缀合反应时，需要考虑的因素很少：1）溶剂：在大多数情况下，活性染料应溶于无水二甲基甲酰胺（DMF）或二甲基亚砜（DMSO）中。 2）反应pH：胺与琥珀酰亚胺酯的标记反应强烈依赖于pH。胺反应性试剂与非质子化脂族胺基团反应，包括蛋白质的末端胺和赖氨酸的β-氨基。因此，胺酰化反应通常在pH 7.5以上进行。通过琥珀酰亚胺酯进行的蛋白质修饰通常可以在pH 8.5-9.5下进行。 3）反应缓冲液：使用胺反应试剂时，必须避免使用含有游离胺（如Tris和甘氨酸）和硫醇化合物的缓冲液。广泛用于蛋白质沉淀的铵盐（例如硫酸铵和乙酸铵）也必须在进行染料缀合之前除去（例如通过透析）。 4）反应温度：大多数缀合在室温下进行。然而，特定标记反应可能需要升高或降低的温度。金畔生物是AAT Bioquest的中国代理商，为您提供最优质的iFluor 810 琥珀酰亚胺酯。 

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操作步骤

1.准备蛋白质储备溶液（溶液A）：

将100μL反应缓冲液（如1 M碳酸钠溶液或1 M磷酸盐缓冲液，pH~9.0）与900μL目标蛋白溶液（如抗体，蛋白质浓度> 2 mg / ml，如果可能）混合至100μL给予1 mL蛋白质标记原液。

注1：蛋白质溶液（溶液A）的pH值应为8.5±0.5。如果蛋白质溶液的pH低于8.0，则使用1M碳酸氢钠溶液或1M pH 9.0磷酸盐缓冲液将pH调节至8.0-9.0的范围。

注2：蛋白质应溶解于pH7.2-7.4的1X磷酸盐缓冲盐水（PBS）中。如果蛋白质溶解在Tris或甘氨酸缓冲液中，则必须用pH7.2-7.4的1X PBS透析，以除去广泛用于蛋白质沉淀的游离胺或铵盐（例如硫酸铵和乙酸铵）。

注3：不纯抗体、牛血清白蛋白（BSA）或明胶稳定的抗体不会被很好地标记。叠氮化钠或硫柳汞的存在也可能干扰缀合反应。可以通过透析或旋转柱除去叠氮化钠或硫柳汞，以获得极佳标记结果。

注4：如果蛋白质浓度低于2 mg / mL，则结合效率会显着降低。为获得极佳标记效率，建议极终蛋白质浓度范围为2-10 mg / mL。

2.准备染料储备溶液（溶液B）：

将无水DMSO加入到iFluor 染料SE小瓶中以制备10-20mM储备溶液。 通过移液或涡旋混合均匀。

注意：在开始缀合前准备染料储备溶液（溶液B）。 及时使用。 染料储备溶液的长期储存可降低染料活性。 溶液B可在冰箱中保存两周，避光保存。 避免冻融循环。

3.确定极佳染料/蛋白质比例（可选）：

注意：每种蛋白质都需要不同的染料/蛋白质比例，这也取决于染料的性质。蛋白质的过度标记可能不利地影响其结合亲和力，而低染料/蛋白质比率的蛋白质缀合物会降低灵敏度。我们建议您通过使用连续不同量的标记染料溶液重复步骤4和5来实验确定极佳染料/蛋白质比率。通常，对于大多数染料 – 蛋白质缀合物，推荐使用4-6种染料/蛋白质。

3.1使用10：1摩尔比的溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）作为起始点：将5μl染料储备溶液（溶液B，假设染料储备溶液为10 mM）加入到样品瓶中。蛋白质溶液（95μl溶液A）有效摇动。假设蛋白质浓度为10mg / mL并且蛋白质的分子量为~200KD，蛋白质的浓度为~0.05mM。

注意：蛋白质溶液中DMSO的浓度应<10％。

3.2运行缀合反应（参见下面的步骤4）。

3.3重复＃3.2，溶液B /溶液A的摩尔比为5：1;分别为15：1和20：1。

3.4使用预制的旋转柱纯化所需的缀合物。

3.5计算上述4种结合物的染料/蛋白质比（DOS）（见说明书）。

3.6运行上述4种结合物的功能测试，确定极佳的染料/蛋白质比例，以扩大标记反应。

4.运行结合反应：

4.1有效加入适量的染料储备溶液（溶液B）到蛋白质溶液（溶液A）的小瓶中晃动。

注意：溶液B /溶液的极佳摩尔比由步骤3.6确定。如果跳过步骤3，我们建议使用10：1溶液B（染料）/溶液A（蛋白质）的摩尔比。

4.2继续在室温下旋转或摇动反应混合物30-60分钟。

5.纯化缀合物

以下方案是使用Sephadex G-25柱纯化染料 – 蛋白质缀合物的实例。

5.1按照制造说明准备Sephadex G-25色谱柱。

5.2将反应混合物（直接从步骤4）加载到Sephadex G-25柱的顶部。

5.3样品在顶部树脂表面下方运行时立即加入PBS（pH 7.2-7.4）。

5.4向所需样品中加入更多PBS（pH 7.2-7.4）以完成色谱柱纯化。 合并含有所需染料 – 蛋白质缀合物的级分。

注1：立即使用时，染料 – 蛋白质偶联物需要用染色缓冲液稀释，并等分多次使用。

注2：对于长期储存，染料 – 蛋白质缀合物溶液需要浓缩或冷冻干燥

参考文献

Nanovesicle delivery to the liver via retinol binding protein and platelet-derived growth factor receptors: how targeting ligands affect biodistribution
Authors: Ching-Yun Hsu, Chun-Han Chen, Ibrahim A Aljuffali, You-Shan Dai, Jia-You Fang
Journal: Nanomedicine (2017)

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