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SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634786	SMART-Seq mRNA Single Cell LP	24 Rxns	￥17,917
Clontech	634787	SMART-Seq mRNA Single Cell LP	96 Rxns	￥60,919
Clontech	634788	SMART-Seq mRNA Single Cell LP	4×96 Rxns	￥219,310
Clontech	634789	SMART-Seq mRNA Single Cell	24 Rxns	￥15,184
Clontech	634790	SMART-Seq mRNA Single Cell	96 Rxns	￥51,626
Clontech	634785	SMART-Seq mRNA Single Cell	4×96 Rxns	￥185,856

SMART-Seq mRNA Single Cell LP & SMART-Seq mRNA Single Cell

◆ 操作简便，基于Plate的工作流程 – 可直接以FACS或其他方法分选的单细胞起始 ◆ 单管操作流程 – SMART-Seq mRNA Single Cell LP包含完整的cDNA合成和文库构建流程，分别在单管中进行，减少样品损失与混淆，降低手动操作误差 ◆ 灵敏度高且一致性好 – 非常适用于单细胞（尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核）RNA-Seq的研究，可检测更多基因 ◆ 可靠的全长cDNA分析 – 性能优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如Smart-seq2 ◆ 测序性能 – SMART-Seq mRNA Single Cell LP搭配Unique Dual Index kits（单独购买)，即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪（如Novaseq）分析，也能得到正确结果 ◆ 更高的文库产量 – 更便于使用高通量型Illumina测序仪分析（如Novaseq），或保存剩余的文库用于多次测序 ◆ 高度灵活的工作流程 – 可与自动化设备兼容     ◇ SPT Labtech mosquito HV user guide     ◇ Formulatrix MANTIS Microfluidic Liquid Handler user guides         · Full-volume         · Quarter-volume   ■ 产品说明： SMART-Seq mRNA Single Cell Kit (SSmRNA Single Cell) 和SMART-Seq mRNA Single Cell LP Kit (SSmRNA Single Cell LP) 是两款具有高灵敏度和高可再现性、适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析试剂盒。试剂盒采用oligo（dT）引物，可从一些RNA含量非常低的单细胞（如PBMC、T细胞、B细胞）直接起始，合成高品质的全长cDNA。使用SSmRNA Single Cell LP kit搭配 Unique Dual Index kits （单独购买)，最多可以制备384 Illumina测序文库。SSmRNA Single Cell LP kit提供完整的单细胞RNA-Seq分析流程，包含从样本制备cDNA、文库构建以及搭配使用的生物信息学分析软件进行数据分析的流程。 SSmRNA Single Cell是基于SMART技术(Switching Mechanism at 5′ End of RNA Template)，提供全长转录本信息，支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等，具有更高的再现性和均一的gene body覆盖度，而且高GC含量转录本也能得到正确的分析。同时，Takara科学家对这一技术进行优化改良，使得这个试剂盒更适合单细胞分析，能得到更多有效reads、更高的基因检测数，对珍贵样本的分析更加深入！ SSmRNA Single Cell LP在包含核心的cDNA合成试剂基础上，同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及单次使用的双端特殊index（UDI），提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶，以实现对合成cDNA的片段化，利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段，单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库！ 如果是以高品质的少量细胞(＜1,000)或者微量Total RNA起始时，推荐使用SMART-Seq mRNA LP Kit或SMART-Seq mRNA LP (with UMIs) Kit。 如果是以随机引物起始，对少量细胞或者降解的Total RNA样本进行RNA-Seq分析时，推荐使用SMART-Seq Stranded Kit。   ■ 实验流程概要：

图1. SMART-Seq mRNA Single Cell & SMART-Seq mRNA Single Cell LP的cDNA合成流程

图2. SMART-Seq mRNA Single Cell LP的文库制备工作流程

■ 数据展示：

注：以下展示来源于SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和 SMART-Seq Single Cell PLUS (SSsc PLUS)的数据。因为两者分别是SMART-Seq mRNA Single Cell 和SMART-Seq mRNA Single Cell LP等效替换品。

● 灵敏度更高的单细胞全长转录组分析

图3. 与Smart-seq2法的比较

Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc，18个重复)和Smart-seq2法（Smart-seq2，20个重复）合成cDNA（均进行19个PCR循环扩增），所有样本都均一化至1.75M paired-end reads，然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。 Panel A 根据cDNA的制备方法不同，结果也不同。相比而言，Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高，而检测到基因鉴别的reads数相对较少。 Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。

● SMART-Seq mRNA Single Cell LP提供完整的单细胞RNA-Seq建库体验！

图4. 与其他同类产品比较数据

Panel A. 以10 pg小鼠脑total RNA起始，采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。随后分别采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库，并比较性能差异。 Panel B. 从测试数据中可以看出，SSsc PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍，而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪，如Novaseq。 Panel C. 两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序，并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。相较于A公司文库，SSsc PLUS文库能检出更多的基因，从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息！

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